Cuando el vuelo 627 aterriza con todo el pasaje y la tripulación muerta, la Agente del FBI Olivia Dunham es llamada para inverstigar los hechos. Todos los muertos parecen haberse "derretido" fruto de un agente contagioso por el aire. Todo apunta a un acto terrorista, pero poco a poco se darán cuenta de que hay cosas que están por encima del terrorismo e incluso por encima de la propia imaginación. ¿Que pasaría si la ciencia llegara a evolucionar hasta tal punto que no pudieramos controlarla?

Esta segunda temporada de Fringe contiene mundos (y mundos alternos) de completa excitación con cambiadores de forma, cabezas criogénicas, bestias moradoras de vientres y personas que se convierten en cenizas ante nuestros ojos. Pero la tónica general de la historia lleva a tres clandestinos agentes del FBI - Olivia Dunham, Peter Bishop y Walter Bishop - a embarcarse en la alucinante investigación de una realidad paralela que amenaza con destruir la nuestra.

El equipo Fringe escapa de un universo paralelo, excepto Olivia, atrapada en otro mundo y remplazada en el nuestro por su doble, que convierte la indecisa relación de Peter y Olivia en un asunto amoroso. Entonces vuelve Olivia, los lazos de confianza se rompen, incluso un extraño y terrorífico fenómeno ocurre, y secretos que se remontan a 1985 tratarán de destruir nuestro universo. O el de ellos...

Quién eres? Tras sacrificarse para salvar ambos mundos, Peter misteriosamente regresa al nuestro. Pero ha sido olvidado por Olivia, Walter, por todo el mundo. Es como si nunca hubiera existido. Al mismo tiempo, los cambia-formas controlados por un maestro desconocido comienza un ataque de destrucción, y ahora los dos universos antiguamente enemigos deben cooperar para defender una rival común. Estos 22 episodios de la cuarta temporada siguen inspirados en fenómenos asombrosos, desconcertantes secretos y dramáticas historias basadas en los personajes. En esta temporada, los sucesos probarán que la fuerza más poderosa en nuestro universo o el suyo, no es un dispositivo que acabe con el mundo, una fuerza paranormal, sino el amor humano.

El año es 2036. Los Observadores se han convertido en crueles gobernadores, limitando la libertad y envenenado poco a poco la atmósfera terrestre, de tal forma que sólo ellos puedan sobrevivir. Sin embargo, no todo está perdido. Una serie de cintas, preservadas en ámbar, contienen detallados planes para derrocar a los Observadores y restaurar el planeta y a sus habitantes. El equipo Fringe llevará acabo la misión más importante de todos los tiempos: recuperar las cintas, seguir las pistas, descifrar el código y prepararse para la batalla final.