Un episodio típico de Toonsylvania comienza con una serie de dibujos animados llamada "Frankenstein" (una parodia de la novela de Mary Shelley del mismo nombre ), sobre las aventuras del Dr. Frankenstein (con la voz de David Warner ), su asistente Igor (con la voz de Wayne). Knight ), que siempre se propone demostrar que es un genio como su maestro, y su ingenioso Monstruo de Frankenstein conocido como Phil (expresado por Brad Garrett). Antes de la segunda caricatura, hay una viñeta animada donde Igor está en el sofá con Phil e intenta arreglar el control remoto de la TV, pero en cada episodio hay un nuevo problema con él (un gag similar al de los gags del sofá que se ven en Los Simpsons ) . Después de eso, hay una serie de dibujos animados llamada "La noche del Fred viviente", sobre una familia de zombies. Este segmento fue creado por el dibujante Mike Peters . A veces, una parodia de una película de terror de la lista B saldría al aire en lugar de una caricatura de "La noche del Fred viviente". Después de eso, hay un segmento corto llamado "Minuto de la Ciencia de Igor", donde Igor da una lección de ciencia (ya sea una pieza musical o una pieza hablada) que siempre termina en un desastre. El segmento final es "Morbid Morals" de Melissa Screetch, donde Phil, el monstruo de Frankenstein, hace algo malo e Igor lo castiga leyendo un cuento de terror que involucra a una niña mocosa llamada Melissa Screetch (interpretada por Nancy Cartwright ) que no hace caso de las advertencias de los adultos. (generalmente dado por su madre) y sufre las consecuencias de una manera u otra por ello.

En la temporada 2, Bill Kopp y Jeff DeGrandis abandonaron el programa y fueron reemplazados por Paul Rugg . El formato de la serie se convirtió en más de un estilo de comedia, con Igor, el Dr. Frankenstein y Phil interactuando con una variedad de nuevos personajes, incluido un vecino entrometido Seth Tuber (con la voz de Jonathan Harris ), que estaba basado en Norman Bates de Psycho . Él interactuó con su madre "inmóvil" poniendo su mano sobre su boca y hablando con ella. También había una típica mafia enojada de Transilvania que, de hecho, era un alegre grupo de hipsters pintorescos de los Beatles . La mayoría de estos nuevos personajes fueron expresados ​​por Paul Rugg , quien también improvisó muchas de sus líneas. Los únicos otros segmentos de copia de seguridad que se materializaron en la segunda temporada fueron las parodias de la película B (aunque se emitieron algunos episodios de "La noche del Fred viviente") y Melissa Screetch en un nuevo segmento llamado "The Melissa Screetch Show". Cuando Melissa estaba decepcionada con un amigo o un miembro de la familia, iba a su casa y se cubría con las sábanas donde fingía ser la anfitriona de un espectáculo. Luego tuvo a su transgresor como estrella invitada y, a menudo, los eliminó de manera irónica.