Alors qu'on le croyait tombé sous les balles de Gennaro Savastano, Ciro Di Marzio, qui porte bien son surnom d'immortel, refait surface. Il reste pour l'instant, dans le plus grand secret, sous la protection de Don Anielo. Gennaro, lui, s'est retiré des affaires. Don Anielo propose à Ciro de participer à une affaire d'envergure montée avec la mafia russe, et l'envoie à Riga, en Lettonie.

À Naples, deux clans de La Camorra, dirigés respectivement par Don Pietro Savastano et Don Salvatore Conte, s'opposent pour avoir la mainmise sur les différents trafics de la ville. Don Pietro Savastano, vieillissant, va prochainement passer le relais à son fils, Gennaro Savastano. Mais "Genny" est encore trop immature pour diriger seul. Don Pietro demande alors à l’un de ses hommes de main, fidèle et fiable, Ciro, d’initier son fils au rôle de mafioso, afin d’en faire un "homme". Bientôt, "Genny" sera à la tête du clan Savastano. S’en suivra un conflit générationnel entre les jeunes, amis de "Genny", et les anciens, dont fait partie Ciro, mettant en péril la survie du clan.

Don Pietro a été libéré par ses hommes du fourgon de police pendant le transfert. Ciro, après avoir fait une alliance avec Salvatore Conte, met en sécurité Deborah et sa fille Maria Rita en vue de la revanche à venir des Savastano. Sa femme, cependant, nourrit une inquiétude croissante sur le sort de sa jeune fille, au point d'être tentée de trahir le clan et de se rendre à la police. Pendant ce temps, Genny lutte pour sa survie à l'hôpital.

La mort de Don Pietro rend inévitable une redistribution des cartes. Ciro a terrassé son vieil ennemi mais son ambition semble évanouie : il a besoin de temps pour panser ses plaies. Gennà règne maintenant sur le territoire du nord de Naples hérité de son père et sur les affaires romaines de son beau-père. Le business n'étant plus aussi juteux qu'autrefois dans son quartier de Naples, Gennà cherche de nouveaux débouchés , notamment dans le centre de la ville. Ce territoire étant fermement tenu par de vieilles et puissantes familles mafieuses, l'héritier Savastano va devoir conclure de nouvelles alliances.

Débarrassé de ses rivaux, Genny règne sans partage sur le centre de Naples tandis que Patrizia a les coudées franches pour mener son trafic. Ce moment de répit est de courte durée. Déjà de nouvelles menaces surgissent, visant directement la famille de Genny... Après le final dévastateur de la saison 3 marquée par la mort de Ciro, la suite s'articule autour d'un nouvel équilibre des pouvoirs au sein de la Camorra napolitaine.

Gennaro et Ciro de nouveau réunis pour l'ultime saison de Gomorra.