Une nouvelle aventure commence dans le vaste monde des Pokémon ! En arrivant à l’Académie Indigo, une jeune fille nommée Liko reçoit son tout premier Pokémon partenaire, Poussacha. Mais très vite, elle se retrouve poursuivie par les Explorateurs, un mystérieux groupe déterminé à s’emparer du pendentif qu’elle porte autour du cou. Heureusement, Liko n’est pas seule : Friede, le Capitaine Pikachu et les autres membres des Voltigeurs Volt-Terre lui offrent leur protection à bord de leur aéronef. Pendant ce temps, un jeune garçon nommé Roy rêve de devenir Dresseur de Pokémon, sans se douter du secret que renferme l’Antique Poké Ball qu’il transporte. Alors que Liko, Roy et les Voltigeurs Volt-Terre lèvent l’ancre vers de nouveaux horizons, quelles découvertes les attendent ?