La première saison débute en 52 avant J.-C., alors que Jules César achève sa conquête de la Gaule après huit années de guerre et s'apprête à rentrer à Rome avec son armée. Tandis que sa nièce Atia, guidée par ses propres intérêts, et son ancienne amante Servilia attendent avec impatience son retour, les patriciens au pouvoir redoutent que ce retour ne vienne bouleverser l'ordre établi. À mesure que les légions de César approchent de Rome, les allégeances des soldats comme des civils sont mises à rude épreuve, et les tensions croissantes culminent en un conflit d'envergure qui changera le cours de l'histoire.

La saison 2 reprend là où la saison 1 s'était arrêtée : avec l'assassinat de Jules César en 44 av. J.-C. et la mort quasi simultanée de Niobé, épouse de Lucius Vorenus, le fidèle garde du corps de César. Démis de ses fonctions après avoir appris que Lucius, son petit-fils présumé, était en réalité le fils illégitime de Niobé, Vorenus sombre dans la folie, rongé par le remords de n'avoir pu protéger César, par sa responsabilité dans la mort de son épouse et par la rumeur du meurtre de ses filles, dont il était séparé.