A série começa de forma explosiva com a emboscada a uma escolta policial no qual três agentes policiais são abatidos e uma testemunha protegida gravemente ferida. O único polícia que sobrevive é a inspetora Lindsay Denton. O subchefe de polícia Mike Dryden assume a liderança e atribui o caso à AC-12. O detetive Steve Arnott, a detetive Kate Fleming e o superintendente Ted Hastings são acompanhados pela recentemente nomeada detetive Georgia Trotman para investigar um complexo caso rico em situações inesperadas. Denton, inicialmente a testemunha mais valiosa da AC-12 neste caso, poderá agora tornar-se no principal suspeito...

Ocorre o tiroteio fatal de um suspeito por uma unidade especial liderada pelo sargento Danny Waldron. Líder altamente proficiente, o seu comportamento imprevisível está a tornar-se uma ameaça para colegas e suspeitos. Quando a AC-12 é chamada para investigar a conduta de Danny, também os seus elementos poderão sentir-se na mira do inimigo...

Quando Roz Huntley captura um assassino em série, o principal investigador forense alerta a AC-12 para um possível erro de justiça. Num caso que define uma carreira, Roz está sob intensa pressão dos seus superiores para capturar um assassino em série, após meses de investigação infrutífera. Quando outra jovem é sequestrada, Roz entra em cena para perseguir e acusar um homem de 24 anos. Mas as dúvidas em torno da culpa do jovem levam o principal investigador forense à brigada anticorrupção…

A unidade anticorrupção AC-12, liderada por Ted Hastings, e que integra os agentes Kate Fleming e Steve Arnott, enfrenta um novo crime. Vários homens de cara coberta intercetam um veículo protegido pela polícia, que transporta droga apreendida, e três agentes são assassinados durante o ataque. Tudo parece indicar que se trata de um crime planeado a partir de dentro. Conhecidos por terem ligações a polícias corruptos, John Corbett e Lisa McQueen, duas figuras centrais de um perigoso grupo do crime organizado suspeito de estar sob o comando de uma personagem conhecida apenas por "H", tornam-se alvo do interesse da AC-12. Mas o caso atinge os agentes mais perto do que nunca quando as suspeitas sobre a misteriosa identidade de "H" começam a apontar para a pessoa que menos esperavam: Ted Hastings.

Decorrido um ano e meio após os eventos da última temporada, a controversa unidade policial anticorrupção AC-12 enfrenta o seu adversário mais enigmático: a inspetora-chefe Joanne Davidson, que investiga o assassinato não resolvido da jornalista Gail Vella. A conduta não convencional de Davidson levanta suspeitas à AC-12, que começa a questionar os factos e se Joanne está a fazer tudo ao seu alcance para encontrar o autor do crime. A equipa conduz uma investigação urgente, mas convulsões dentro da própria AC-12 ameaçam destruir todo o esforço.