A série segue a história do destróier americano USS Nathan James, em um mundo apocalíptico onde eles estão entre os poucos sobreviventes após um fenômeno desconhecido causado por um super vírus. O Capitão Tom Chandler (Eric Dane) é responsável por encontrar a cura para um vírus que está dizimando os seres humanos. Em sua embarcação, estão a Tenente Jackie Makena (Michaela McManus), o Chefe Hugh Jeter (Charles Parnell), o líder da equipe de fuzileiros navais Danny Green (Travis Van Winkle), a Tenente Alisha Granderson (Christina Elmore) e as especialistas em paleomicrobiologia Quincy (Sam Spruell) e Rachel Scott (Rhona Mitra). O Capitão e sua tripulação precisam descobrir uma nova maneira para sobreviverem com o vírus na Terra.

Na segunda temporada, eles precisarão lidar com as consequências da chegada do navio à costa dos Estados Unidos, e com a reação da população local à vacina recém-descoberta.