Как ни странно, но первая серия начинается не с того как Питера кусает паук. Видно, что тот уже достаточное время летает на паутине. Это единственный сезон, в котором Питер надевает Чёрный костюм, точнее сливается с Симбионтом. Уже в первом сезоне у Паука много врагов и ни одного союзника. В этом сезоне всего 13 серий. У Человека-паука появится 12 врагов: Ящер, Смайт, Амбал (в комиксах — КингПин), Доктор Октопус, Мистерио, Скорпион, Крэйвен-Охотник, Рино (в комиксах — Носорог), Громила (в комиксах — Шокер), Чёрная Смерть (в комиксах — Веном), Домовой (в комиксах — Хобгоблин) и Хамелеон.

Более сплочённый сезон и является одной большой историей, как Человек-паук переживал некий Неогенный кошмар — превращаясь в Сверхпаука (гигантского настоящего паука), он терял силы и его структуры клетки постоянно менялись, уже давно ему было ясно, что он — мутант. Также в этом сезоне у Паука появляются союзники — представители из других вселенных Марвел: Люди Икс, Блейд и Каратель (который сначала являлся противником). Пауку стало труднее — его злейшие враги объединились и под руководством Амбала взяли название Коварная Шестёрка.

В этом сезоне мир Человека-паука расширяется за счёт гармоничного включения в него магии, которая в отдельных случаях неплохо ладит с наукой. Несмотря на название, грехам отцов посвящены не все серии. Действительно, в части из них мы узнаём о прошлом некоторых ключевых персонажей, о роли семьи в их жизни. Но весь сезон объединяет мадам Паутина — загадочная провидица, появившаяся в жизни Человека паука. Она обладает невероятными мистическими возможностями такими как телепатия, контроль над пространствами. Она с лёгкостью спасает несколько раз ему жизнь, иногда просто перемещая его в пространстве, но чаще давая полезные советы, хоть он и не сразу понимает смысл её туманных фраз. По её словам она готовит Питера к некой великой битве, самой важной в его жизни. Как потом оказывается, человеку-пауку предстоит сразится с симбионтом Потрошителем (Карнажем) и Смертоносцем (Веномом). Также в этом сезоне появляются новые союзники — Доктор Стрэндж, Железный Человек и Сорвиголова.

Паук встречает своего самого долговременного союзника — таинственную Чёрную Кошку, с которой позже завяжет короткий роман. Единственная причина окончания этого романа — появление пропавшей Мэри Джейн. Самый короткий сезон.