法证部的高级化验师高彦博(欧阳震华饰)工作出色，备受讚许，遗憾是妻子古泽瑶(刘锦玲饰)，因为意外而瘫痪，但是，多年来他对妻子不离不弃，情深一片，赢得众人，尤其是舅仔兼法医科医生古泽琛(林文龙饰)的佩服与讚誉，故而两人感情要好。可惜瑶被诊断出患上癌症，祸不单行是她食过博送来的食物后竟突然死亡，令人怀疑博对妻子下毒手。尤其是警察部重案组的高级督察梁小柔(蒙嘉慧饰)，更怀疑博与丁沛沛(陈芷菁饰)旧情复炽，急不及待要解决瑶这个包袱。加上柔的弟弟梁小刚(郑俊弘饰)是法证部的技术员，正是博的下属，却事事受他挑剔，但博对沛之妹妹林汀汀(锺嘉欣饰)却循循善诱，令柔觉得厚此薄彼，不满博。 后来，柔的父亲梁兴隆(于洋饰)因为不甘被梁兴忠所骗，与忠起争执，事后忠被杀，隆在人证、物证确凿下成为杀人疑犯。此时，博再以其客观理智的态度，与琛锲而不捨地反覆验证，找出疑点，终揭发真凶。柔喜见父亲沉冤得雪，对博大为感激，更对他博学而机智，不偏不倚的验证态度信服，对他大为改观。琛除了法医工作之外，亦将自己的见闻创作出一系列推理小说，深受读者欢迎，女友汀亦是其拥趸之一。未几，在琛小说中出现的败类竟相继意外死亡，初时琛与博、柔以为纯属巧合，但渐渐觉得是有人模仿琛的小说进行地下裁判，滥用私刑，琛更因此而成为争议对象，饱受压力。汀为了替男友澄清，尽力追查凶手谁属，但正当她找到线索时，却突然受袭昏迷，生死未卜。琛大为紧张，柔决定设局引出真凶。一日，一个神秘人暗暗向博发出了战书。一宗血案的凶手留下的指纹竟属博，所有现场的不利证据矛头均直指博，意味著整个法证部似是备受挑战。

琛的未婚妻汀汀在爆炸案中丧命，博的女友小柔亦丧失持枪能力，其工作交由马帼英接手，英深深吸引著琛及昇。综合鑑证智慧、逻辑推理及医学知识，三人为追凶寻证奋不顾身，但在相知相遇中却挣脱不了感情的牵绊。

一連串的離奇命案將法證部高級化驗師布國棟、法醫部高級法醫鍾學心、重案組高級督察凌倩兒和沙展李展風等人聯繫起來。這群專業的人員，從鑑證、化驗、邏輯、心理、醫學及科學等不同範疇，跨部門聯合破案緝兇，竭力維護法紀。

香港法证部高级化验师高安（黄浩然饰）、法医科高级医生闻家希（李施嬅饰）、西九龙重案组高級督察郭辉煌（谭俊彦饰），这「灭罪铁三角」带领着精英团队，用专业的法证科学，揭示惊人的预谋策划；用精密的法医知识，破解隐蔽的人体密码；用严谨的执法精神，披露震撼的罪恶真相！热血记者徐意（汤洛雯饰），童年憾事竟与高安紧扣牵连；法证专才水慧明（陈炜饰），遭至爱背叛顿成杀人疑凶；警队精英高靖（朱晨丽饰），锲而不舍追寻亲人被诱拐真相...... 谜团奇案，重重交错；冷血凶徒，幕幕惊心！人在做，天在看！「灭罪铁三角」坚守「邪不胜正，恶不抵善」的信念，誓为死者发声，替生者雪冤！

法证事务部高级化验师余星柏（黄宗泽饰）以精辟方法找出证据，受热血女警霍宝英（王敏奕饰）倾慕，谱出一段无法以科学计算的爱情。法医科高级医生范佩清（蔡洁饰）冷静睿智，得流氓医生秦克男默默守护。重案组高级督察井浩然（袁伟豪饰）不眠不休，与斜杠女子谭倩雯（蔡思贝饰）互相扶持，追寻真相。面对消失的证据、迷失的困局、狡猾的凶手，法证团队要还生者公道，替死者雪冤！

面对一个个错综复杂的悬疑案件，法证部高级化验师余星柏（黄宗泽 饰）、重案组高级督察井浩然（袁伟豪 饰）、法医科高级医生范佩清（蔡洁 饰）三人团将如何一步步抽丝剥茧，在危机四伏的谜团中，用科学揭露事实寻觅真相？在面临生死时，他们又将如何坚守本心，完成对自我和他人的救赎？一切答案都将在本季剧集中揭晓。