松江县令谭振英有卜算前世预测未来的超常本领，每当有命案发生都有神秘感，因此从小立志要做再世“包青天”。时逢康熙为父皇顺治爷失踪而焦头烂额，谭左掐右算不仅帮助康熙渡过了被人刺杀险境并成功地挖出了隐藏事实背后更大凶手，因此得到康熙信任；康熙十分敬重的奶娘五十大寿上出了一个非常离奇诡异事情，接二连三的怪事频繁不断，无人击鼓却闻鼓声如雷，亡魂牵引着谭振英揭开了一个丧生十余口性命的真相，真相却牵连着康熙感情；康熙微服出巡收留了一个街头卖身“龙儿”“龙儿”深得皇太后喜爱却引来自己与母亲无故被人追杀，逆境时谭抽丝剥茧竟揭开康熙民间一段风流往事；朝中一武将儿子为争夺一客栈老板娘美貌千金而不慎将一王爷儿子打死，谭奉命调查却查出武将之子乃王爷与老板娘私生子，这一切竟是老板娘复仇的计划；驸马爷面对自己母亲与亲弟而茫然不识，引起谭猜疑暗中查证发现了一个天大阴谋。

青天衙门Ⅱ由《将军之爱》、《望子成龙》、《审妻记》、《花轿奇谋》四个部分组成。在一旱雷闷响的夜晚，顺天府街外一名泪水纵横哭泣声只见喊的书童，手持鼓棒正呜鼓喊冤。身任顺天府尹的谭振英听闻。立率人出门，并连夜审问其因。方庆被提到公堂上，泣诉了少爷方之栋与余清莲，本为一对青梅竹马的恋人，但因迫于无奈，清莲流落风尘沦为卖艺之女。